De acordo com a gramática normativa o certo é mixaria. Isso é porque a palavra mixaria é derivada do radical mixe, que, por sua vez, vem do Guarani mi'xi, que significa pequeno ou pouco.
Nós recebemos uma mixaria pelo trabalho.
Esse erro é comum porque o som que as unidades gráficas 'X' e 'CH' representam é o mesmo e não existe nenhuma regra fixa que determine como a palavra deve ser escrita. Ou seja, só dá pra saber que a palavra é escrita com X conhecendo ela antes ou sabendo da origem dela no Guarani.